La biologie évolutive explique comment le vivant est devenu ce qu'il est. Sélection naturelle, dérive génétique, mutation, migration et recombinaison : cinq forces suffisent à transformer une population au fil des générations.
Nos cinq sections rassemblent 21 cours et travaux universitaires, des mécanismes de l'évolution et de la spéciation jusqu'à la phylogénie et à l'évolution humaine. Elles vont de Darwin et Wallace à la synthèse moderne et à la génétique des populations d'aujourd'hui.
Tout est en PDF, téléchargeable immédiatement et sans inscription. Commencez par un cours d'introduction si vous débutez, ou allez droit aux travaux de recherche si vous préparez un master.
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Mécanismes
Livres de Mécanismes de l'Évolution
Sélection naturelle, dérive, mutation, recombinaison, migration : cinq forces suffisent à expliquer comment une population change au fil des générations. Ces cours reprennent chacune depuis le début, sans présupposer autre chose que des bases de biologie.
Un cours universitaire complet qui reprend l'évolution depuis les preuves fossiles jusqu'à la spéciation, en passant par la sélection naturelle, la dérive et la valeur adaptative. Chaque chapitre se termine par des questions à réflexion, ce qui en fait un vrai support de travail et pas seulement une lecture.
Comment la complexité apparaît-elle sans qu'aucune force ne la dirige ? Cette thèse répond en faisant évoluer des organismes numériques sur des milliers de générations, une approche qui rend visibles des mécanismes impossibles à observer sur le vivant réel.
Le polycopié de licence qui met les cinq forces évolutives à plat : mutation, migration, sélection, dérive et recombinaison. Il enchaîne ensuite sur la notion d'espèce, les modes de spéciation et l'évolution des séquences nucléotidiques.
Une mise au point conceptuelle signée par une systématicienne : ce que l'évolution explique, ce qu'elle n'explique pas, et pourquoi les contraintes du vivant comptent autant que la sélection. Le texte le plus accessible de cette page pour démarrer.
Ici on compte les allèles plutôt que les individus : fréquences, équilibre de Hardy-Weinberg, effet fondateur. C'est la boîte à outils quantitative de toute la discipline, et la section où les exercices corrigés valent autant que la théorie.
Le cours de master qui construit la génétique des populations pas à pas : équilibre de Hardy-Weinberg à un puis plusieurs locus, consanguinité, structure des populations et sélection balancée. Démonstrations complètes et exemples pris sur des données réelles.
Quinze séries d'exercices corrigés, du calcul de fréquences alléliques au test de conformité à Hardy-Weinberg, puis mutations, dérive, sélection, migrations et pressions combinées. Chaque exercice est gradué par difficulté et la table du khi2 est fournie.
Le principe de Hardy-Weinberg tel qu'il est vraiment démontré, avec les hypothèses probabilistes que les manuels laissent souvent dans l'ombre. Court, précis, et utile dès qu'on veut comprendre au lieu d'appliquer une formule.
Un cas d'école de génétique des populations appliquée : comment les chênes ont recolonisé le continent en moins de huit mille ans, ce que l'ADN chloroplastique en garde, et par quels mécanismes leur diversité génétique se maintient face aux pressions de sélection.
Une thèse qui mesure le potentiel évolutif d'un agent pathogène : héritabilité des caractères d'agressivité, recherche d'un locus d'avirulence par étude d'association, et ce que cela implique pour construire des résistances durables.
La boîte à outils statistique de l'évolutionniste : modèles linéaires généralisés, vraisemblance, sélection de modèles et estimation des flux de gènes. Le chapitre à lire avant d'attaquer un jeu de données de terrain.
Jean-Dominique Lebreton, Étienne Klein, Olivier Gimenez et François Rousset
La diversité du vivant n'est pas un décor : c'est le résultat mesurable de l'évolution, et son point de départ pour la suite. Ces documents relient les deux.
Le parcours complet en un seul document : diversité des milieux, des espèces et des gènes, puis sélection naturelle, dérive génétique et apparition de nouvelles espèces. La progression la plus claire de cette page pour qui découvre le sujet.
Le cours qui replace l'évolution dans son histoire : de la fixité des espèces à Buffon, Lamarck et Darwin, puis symbioses, coévolution et plasticité du génome. Il aborde aussi les dérives du darwinisme social, ce que peu de cours font.
La suite du cours de biologie animale, consacrée à la biodiversité elle-même : ce que le mot recouvre selon qui l'emploie, les grandes disparitions, l'érosion en cours et la question de sa valeur. Beaucoup de graphiques et de chiffres commentés.
Notre lignée est un cas d'école : fossiles rares, datations discutées, hypothèses qui changent tous les dix ans. Ces cours racontent l'état actuel du dossier, des premiers hominidés à Sapiens.
Ce que l'approche évolutive apporte à la compréhension de notre propre espèce : histoire de vie, choix du partenaire, coopération, langage et cognition. Une vingtaine de spécialistes y couvrent chacun un versant du dossier.
Près de cinq cents pages pour suivre l'idée d'évolution humaine depuis Lamarck et Darwin jusqu'à la théorie synthétique et la génétique des populations. Le document le plus complet de cette page sur la dimension historique de la discipline, glossaire compris.
Le cours d'un paléontologue qui a lui-même repoussé l'âge des plus anciens hominidés connus de trois à sept millions d'années. Origine, phylogénie, paléoenvironnements et biodiversité des primates, racontés par celui qui a décrit Toumaï.
La fiche de synthèse qui remet de l'ordre dans les espèces de notre famille, des premiers primates du Miocène jusqu'à Sapiens. Photographies de fossiles, âges et caractères diagnostiques pour chaque taxon, sans jargon inutile.
Le cours de première année dit d'entrée ce que les autres passent sous silence : les fossiles sont rares, fragmentaires, souvent réinterprétés, et l'état des connaissances change presque chaque année. Une bonne mise en garde avant d'aller plus loin.
Cent onze pages richement illustrées pour comprendre comment on classe le vivant : caractères et états de caractères, homologie, cladogrammes, taxinomie et nomenclature. Le support le plus visuel de cette section.
Pourquoi on a abandonné la classification par ressemblances au profit de la parenté : phénétique contre cladistique, matrices de caractères et arbre du vivant. On y classe sur ce que les organismes ont, jamais sur ce qui leur manque.
Le cours part de l'histoire des classifications, d'Aristote à Linné puis à Darwin, avant d'expliquer comment on reconstruit un arbre à partir de séquences : alignement, choix du gène, choix de la méthode. Un bon pont entre concepts et pratique.
Le cours de référence sur la reconstruction phylogénétique à partir des séquences : modèles d'évolution, méthodes de distance, maximum de vraisemblance, tests de robustesse et approche bayésienne. Dense, mais complet de bout en bout.
Ces 21 documents couvrent la biologie évolutive du cours de licence à la thèse. Les mêmes mécanismes se retrouvent, à d'autres échelles, dans nos livres d'écologie et nos livres de biologie animale.
Pour l'hérédité, l'ADN et les mutations vues à l'échelle de l'individu, passez par nos livres de génétique. Et pour le reste du domaine, tout notre catalogue de livres de biologie est ouvert.